據了解發現，農民對番茄灰霉病的防治，長期存在單一用藥的習慣，達不到防治目的。只有利用綜合防治才能控制灰霉病的發生。
1.種子：用50-55℃溫水浸種10～15分鐘，要不斷的攪拌，使種子受熱均勻，然后待水溫冷卻到28～30℃時，放在25～28℃的恒溫處催芽。
2．起壟覆膜定植：起壟定植有利于疏松土壤，促進番茄根系發達，又避免因澆水濕度大而引起漚根死苗。覆地膜有利于保持或提升土壤溫度，可隔斷因土壤水分蒸發而增大棚室內濕度和膜面結露等不良生態環境。
3.在膜下澆水24小時后，棚室內相對濕度僅達82％～85％，如果滿溝澆明水24小時后，棚室內相對濕度高達95％～，不但對灰霉病發生十分有利，對其它喜濕病害也極為有利。
4.生態防治：開花結果期，棚室內白天溫度控制22-28℃，夜間10-12℃。相對濕度低于80%時，需15天左右才可產生抱子，其孢子萌發率為0；如果相對濕度在95％以上，灰霉病菌3-4天可大量產孢，48小時孢子萌發率達。由此可見，降濕防病效果非常明顯。
5.藥劑防治：要抓住番茄灰霉病防治時期，因為開敗的花朵是灰霉病菌侵入繁殖的天然培養基，侵害果實引起腐爛。所以要抓住此時機，配合上述的防治措施，再利用、低毒的有效藥劑進行防治。首次用藥在穗果開花期，結合用防落素噴花，在藥液中加入0．1％速克靈等防治灰霉病的藥劑，直接對準雌花噴霧，即防止落花落果，又能防治灰霉病的發生；第二次用藥是在花敗坐果膨大期，為不增加棚室內濕度，應選用防治灰霉病的煙霧劑，在初見發病時，于傍晚封閉好棚室，10延長米放50克（一小包），從外向里放好藥包，然后從里向外點燃。1小時后可放風換氣，10～15天施放一次。在晝夜通風時，發現灰霉病發生，可用65％甲霉靈600倍液噴霧，7天噴一次，連用2一3次，即可達到防治效果。僅供參考。